Sul territorio la FIT si articola in Federazioni regionali, Federazioni territoriali e strutture di posto di lavoro che costituiscono istanza congressuale. Esse esplicano, per la parte di propria competenza, le stesse funzioni della Federazione nazionale, di cui all’art. 2.
A livello territoriale il collegamento con le UST, quando la struttura FIT non è costituita, è tenuto dal rappresentante FIT indicato, in prima istanza, dall’Assemblea territoriale FIT e nominato dalla Struttura competente per territorio. (articolo 22 dello Statuto)